Arbre phylogénétique
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Un arbre phylogénétique est un arbre qui montre les relations de parentés entre les espèces ou d'autres entités supposées avoir un ancêtre commun. Chacun des noeuds de l'arbre représente l'ancêtre commun de ses descendants. L'arbre peut être enraciné ou pas, selon qu'on est parvenu à identifier l'ancêtre commun à toutes les feuilles.
Les arbres phylogénétiques ne considèrent pas les transferts horizontaux, et un nouveau modèle se développe en phylogénie, celui de graphe ou réseau phylogénétique qui permet de les prendre en compte, ainsi que les recombinaisons.
| Sommaire |
Les méthodes de construction
Il existe plusieurs techniques de construction des arbres phylogénétiques, plus ou moins rapides et plus ou moins fiables.
On peut chercher à optimiser plusieurs critères dans l'arbre : la distance, la parcimonie, ou la vraisemblance.
Pour les méthodes de distance, il s'agit tout d'abord de choisir le critère de distance entre les futures feuilles de l'arbre. Par exemple, si ces feuilles sont des séquences d'ADN, on peut choisir comme distance entre deux d'entre elles le nombre de nucléotides qui diffèrent. Pour déterminer cette valeur, on est amené à en effectuer un alignement. Puis on peut utiliser la méthode UPGMA ou celle du Neighbour Joining pour en déduire l'arbre.
Les méthodes de parcimonie consistent à trouver l'arbre qui minimise le nombre de mutations, délétions, ou insertions ponctuelles pour passer d'une séquence à l'autre. C'est une méthode très lente si l'on génère tous les arbres possibles pour en calculer la parcimonie.
Enfin, les méthodes de vraisemblance sont plus probabilistes. En se fondant sur le taux de substitution pour chaque élément de base (nucléotide pour des séquences d'ADN) au cours du temps, on estime la vraisemblance de la position et de la longueur des branches de l'arbre.
Si l'on a obtenu un arbre non enraciné par une des méthodes ci-dessus, on peut tenter d'en trouver la racine par la méthode de l'outgroup ou du point médian. Celle de l'outgroup consiste à ajouter aux séquences traitées, avant le calcul de l'arbre, une très éloignée : le noeud-racine sera le père de cette séquence. Celle du point médian consiste à affecter à chaque noeud de l'arbre une séquence correspondant au consensus de ses fils, et choisir comme racine le noeud dont la séquence est la plus proche de la séquence consensus de toutes les feuilles.
Arbre phylogénétique du vivant
Précautions
Des débats existent entre les systématiciens pour déterminer les critères de classification les plus pertinents. Cette classification, dont le document de synthèse essentiel est le livre Classification phylogénétique du vivant, est susceptible d'être encore grandement modifiée dans les années à venir, selon toute vraisemblance. La tentative de mise au point des connaissances actuelles en matière de classification mise en place par Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader n'est pas à considérer, comme ils le disent eux-mêmes, comme un document définitif.
Des erreurs peuvent avoir été commises dans ce document en cours de réalisation, il n'est pas conseillé de s'y fier. Si vous pouvez y apporter des améliorations, Wikipédia vous en remercie d'avance.
Si vous faites des modifications, veillez à vous référer à la dernière classification en vigueur chez les systématiciens.
Les exemples cités ont été choisis de façon totalement arbitraire.
Arbre
Le vivant ├─Eubactéries ├─Archées └─Eucaryotes ou Eukaryota ├─Lignée verte │ ├─Glaucophytes ou Glaucophyta │ └─Métabiontes │ ├─Rhodobiontes │ └─Chlorobiontes │ ├─Charophytes │ ├─Embryophytes ou Plantae │ │ ├─Anthocérotes │ │ └─CNN │ │ ├─Hépatiques │ │ ├─Mousses │ │ │ ├─Spagnopsida │ │ │ ├─Andreaeapsida │ │ │ └─Bryopsida │ │ └─Trachéobiontes ou Végétal vasculaire │ │ └─CNN │ │ ├─Lycophytes │ │ └─CNN │ │ └─Psylophytes ou Psylophyta │ │ └─CNN │ │ ├─CNN │ │ │ ├─Équisétophytes ou Equisetophyta │ │ │ └─Ptéridophytes │ │ ├─Spermatophytes │ │ ├─CNN │ │ │ ├─Cycadophytes │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─CNN │ │ │ └─Coniférophytes │ │ │ └─Pinopsida │ │ │ │ │ ├─Ginkgophytes │ │ │ │ │ │ │ └─Ginkgoales (ex : Ginkgo biloba) │ │ └─CNN │ │ ├─Gnétophytes │ │ └─Angiospermes │ │ │ │ │ ├─Amborellales │ │ │ └─Amborellaceae │ │ ├─Austrobaileylales │ │ │ │ │ │ │ ├─Austrobaileyaceae │ │ │ ├─Illiciaceae │ │ │ ├─Schisandraceae │ │ │ └─Trimeniaceae │ │ ├─Ceratophyllales │ │ │ └─Ceratophyllaceae │ │ │ │ │ ├──────Chloranthales │ │ │ └─Chloranthaceae │ │ │ │ │ ├─Magnoliids │ │ │ │ │ │ │ ├─Canellales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Canellaceae │ │ │ │ └─Winteraceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Piperales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Aristolochiaceae │ │ │ │ ├─Hydnoraceae │ │ │ │ ├─Lactoridaceae │ │ │ │ ├─Piperaceae │ │ │ │ └─Saururaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Laurales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Atherospermataceae │ │ │ │ ├─Calycanthaceae │ │ │ │ ├─Hernandiaceae │ │ │ │ ├─Lauraceae │ │ │ │ ├─Monimiaceae │ │ │ │ └─Siparunaceae │ │ │ │ │ │ │ └─Magnoliales │ │ │ │ │ │ │ ├─Annonaceae │ │ │ ├─Degeneriaceae │ │ │ ├─Eupomatiaceae │ │ │ ├─Himantandraceae │ │ │ └─Myristicaceae │ │ │ │ │ ├─Monocotylédones │ │ │ │ │ │ │ ├─Corsiaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Acorales │ │ │ │ │ │ │ │ │ └─Acoraceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Alismatales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Alismataceae │ │ │ │ ├─Aponogetonaceae │ │ │ │ ├─Araceae │ │ │ │ ├─Butomaceae │ │ │ │ ├─Cymodoceaceae │ │ │ │ ├─Hydrocharitaceae │ │ │ │ ├─Juncaginaceae │ │ │ │ ├─Limnocharitaceae │ │ │ │ ├─Posidoniaceae │ │ │ │ ├─Potamogetonaceae │ │ │ │ ├─Ruppiaceae │ │ │ │ ├─Scheuchzeriaceae │ │ │ │ ├─Tofieldiaceae │ │ │ │ └─Zosteraceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Dioscoreales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Burmanniaceae │ │ │ │ ├─Dioscoreaceae │ │ │ │ ├─Nartheciaceae │ │ │ │ ├─Taccaceae │ │ │ │ ├─Thismiaceae │ │ │ │ ├─Trichopodaceae │ │ │ │ └─Trichopodaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Pandanales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Cyclanthaceae │ │ │ │ ├─Pandanaceae │ │ │ │ ├─Stemonaceae │ │ │ │ ├─Triuridaceae │ │ │ │ └─Velloziaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Liliales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Alstroemeriaceae │ │ │ │ ├─Calochortaceae │ │ │ │ ├─Campynemataceae │ │ │ │ ├─Colchicaceae │ │ │ │ ├─Liliaceae │ │ │ │ ├─Luzuriagaceae │ │ │ │ ├─Melanthiaceae │ │ │ │ ├─Philesiaceae │ │ │ │ ├─Ripogonaceae │ │ │ │ └─Smilacaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Asparagales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Agapanthaceae │ │ │ │ ├─Agavaceae │ │ │ │ ├─Alliaceae │ │ │ │ ├─Amaryllidaceae │ │ │ │ ├─Anemarrhenaceae │ │ │ │ ├─Anthericaceae │ │ │ │ ├─Aphyllanthaceae │ │ │ │ ├─Asparagaceae │ │ │ │ ├─Asphodelaceae │ │ │ │ ├─Asteliaceae │ │ │ │ ├─Behniaceae │ │ │ │ ├─Blandfordiaceae │ │ │ │ ├─Boryaceae │ │ │ │ ├─Doryanthaceae │ │ │ │ ├─Hemerocallidaceae │ │ │ │ ├─Herreriaceae │ │ │ │ ├─Hesperocallidaceae │ │ │ │ ├─Hyacinthaceae │ │ │ │ ├─Hypoxidaceae │ │ │ │ ├─Iridaceae │ │ │ │ ├─Ixioliriaceae │ │ │ │ ├─Lanariaceae │ │ │ │ ├─Laxmanniaceae │ │ │ │ ├─Orchidaceae │ │ │ │ ├─Ruscaceae │ │ │ │ ├─Tecophilaeaceae │ │ │ │ ├─Themidaceae │ │ │ │ ├─Xanthorrhoeaceae │ │ │ │ └─Xeronemataceae │ │ │ │ │ │ │ └─Commelidoids │ │ │ │ │ │ │ ├─Dasypogonaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Arecales │ │ │ │ │ │ │ │ │ └─Arecaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Commelinales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Commelinaceae │ │ │ │ ├─Haemodoraceae │ │ │ │ ├─Hanguanaceae │ │ │ │ ├─Philydraceae │ │ │ │ └─Pontederiaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Zingiberales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Cannaceae │ │ │ │ ├─Costaceae │ │ │ │ ├─Heliconiaceae │ │ │ │ ├─Lowiaceae │ │ │ │ ├─Marantaceae │ │ │ │ ├─Musaceae │ │ │ │ ├─Strelitziaceae │ │ │ │ └─Zingiberaceae │ │ │ │ │ │ │ └─Poales │ │ │ │ │ │ │ ├─Anarthriaceae │ │ │ ├─Bromeliaceae │ │ │ ├─Centrolepidaceae │ │ │ ├─Cyperaceae │ │ │ ├─Ecdeiocoleaceae │ │ │ ├─Eriocaulaceae │ │ │ ├─Flagellariaceae │ │ │ ├─Hydatellaceae │ │ │ ├─Joinvilleaceae │ │ │ ├─Juncaceae │ │ │ ├─Mayacaceae │ │ │ ├─Poaceae │ │ │ ├─Rapateaceae │ │ │ ├─Restionaceae │ │ │ ├─Sparganiaceae │ │ │ ├─Thurniaceae │ │ │ ├─Typhaceae │ │ │ └─Xyridaceae │ │ │ │ │ │ │ │ └─Eudycotylédones │ │ │ │ │ ├─Sabiaceae │ │ │ │ │ ├─Buxales │ │ │ │ │ │ │ ├─Buxaceae │ │ │ └─Didymelaceae │ │ │ │ │ ├─Trochodendrales │ │ │ │ │ │ │ └─Trochodendraceae │ │ │ │ │ ├─Ranunculales │ │ │ │ │ │ │ ├─Berberidaceae │ │ │ ├─Circaeasteraceae │ │ │ ├─Eupteleaceae │ │ │ ├─Fumariaceae │ │ │ ├─Lardizabalaceae │ │ │ ├─Menispermaceae │ │ │ ├─Papaveraceae │ │ │ ├─Pteridophyllaceae │ │ │ └─Ranunculaceae │ │ │ │ │ ├─Proteales │ │ │ │ │ │ │ ├─Nelumbonaceae │ │ │ ├─Platanaceae │ │ │ └─Proteaceae │ │ │ │ │ ├─Vitaceae │ │ │ │ │ ├─Gunnerales │ │ │ │ │ │ │ ├─Gunneraceae │ │ │ └─Myrothamnaceae │ │ │ │ │ ├─Berberidopsidales │ │ │ │ │ │ │ ├─Aextoxicaceae │ │ │ └─Berberidopsidaceae │ │ │ │ │ ├─Dilleniales │ │ │ │ │ │ │ └─Dilleniaceae │ │ │ │ │ ├─Saxifragales │ │ │ │ │ │ │ ├─Altingiaceae │ │ │ ├─Aphanopetalaceae │ │ │ ├─Cercidiphyllaceae │ │ │ ├─Crassulaceae │ │ │ ├─Daphniphyllaceae │ │ │ ├─Grossulariaceae │ │ │ ├─Haloragaceae │ │ │ ├─Hamamelidaceae │ │ │ ├─Iteaceae │ │ │ ├─Paeoniaceae │ │ │ ├─Penthoraceae │ │ │ ├─Peridiscaceae │ │ │ ├─Pterostemonaceae │ │ │ ├─Saxifragaceae │ │ │ └─Tetracarpaeaceae │ │ │ │ │ ├─Santalales │ │ │ │ │ │ │ ├─Loranthaceae │ │ │ ├─Misodendraceae │ │ │ ├─Olacaceae │ │ │ ├─Opiliaceae │ │ │ ├─Santalaceae │ │ │ └─Schoepfiaceae │ │ │ │ │ ├─Caryophyllales │ │ │ │ │ │ │ ├─Achatocarpaceae │ │ │ ├─Aizoaceae │ │ │ ├─Amaranthaceae │ │ │ ├─Ancistrocladaceae │ │ │ ├─Asteropeiaceae │ │ │ ├─Barbeuiaceae │ │ │ ├─Basellaceae │ │ │ ├─Cactaceae │ │ │ ├─Caryophyllaceae │ │ │ ├─Didiereaceae │ │ │ ├─Dioncophyllaceae │ │ │ ├─Droseraceae │ │ │ ├─Drosophyllaceae │ │ │ ├─Frankeniaceae │ │ │ ├─Halophytaceae │ │ │ ├─Hectorellaceae │ │ │ ├─Molluginaceae │ │ │ ├─Nepenthaceae │ │ │ ├─Nyctaginaceae │ │ │ ├─Physenaceae │ │ │ ├─Phytolaccaceae │ │ │ ├─Plumbaginaceae │ │ │ ├─Polygonaceae │ │ │ ├─Portulacaceae │ │ │ ├─Rhabdodendraceae │ │ │ ├─Sarcobataceae │ │ │ ├─Simmondsiaceae │ │ │ ├─Stegnospermataceae │ │ │ └─Tamaricaceae │ │ │ │ │ ├─Eurosids I │ │ │ │ │ │ │ ├─Huaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Celastrales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Celastraceae │ │ │ │ ├─Lepidobotryaceae │ │ │ │ └─Parnassiaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Oxalidales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Brunelliaceae │ │ │ │ ├─Cephalotaceae │ │ │ │ ├─Connaraceae │ │ │ │ ├─Cunoniaceae │ │ │ │ ├─Elaeocarpaceae │ │ │ │ └─Oxalidaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Oxalidales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Brunelliaceae │ │ │ │ ├─Cephalotaceae │ │ │ │ ├─Connaraceae │ │ │ │ ├─Cunoniaceae │ │ │ │ ├─Elaeocarpaceae │ │ │ │ └─Oxalidaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Rosales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Barbeyaceae │ │ │ │ ├─Cannabaceae │ │ │ │ ├─Cecropiaceae │ │ │ │ ├─Dirachmaceae │ │ │ │ ├─Elaeagnaceae │ │ │ │ ├─Moraceae │ │ │ │ ├─Rhamnaceae │ │ │ │ ├─Rosaceae │ │ │ │ ├─Ulmaceae │ │ │ │ └─Urticaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Fabales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Fabaceae │ │ │ │ ├─Polygalaceae │ │ │ │ ├─Quillajaceae │ │ │ │ └─Surianaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Cucurbitales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Anisophylleaceae │ │ │ │ ├─Begoniaceae │ │ │ │ ├─Coriariaceae │ │ │ │ ├─Corynocarpaceae │ │ │ │ ├─Cucurbitaceae │ │ │ │ ├─Datiscaceae │ │ │ │ └─Tetramelaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Fagales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Betulaceae │ │ │ │ ├─Casuarinaceae │ │ │ │ ├─Fagaceae │ │ │ │ ├─Juglandaceae │ │ │ │ ├─Myricaceae │ │ │ │ ├─Nothofagaceae │ │ │ │ ├─Rhoipteleaceae │ │ │ │ └─Ticodendraceae │ │ │ │ │ │ │ └─Malpighiales │ │ │ │ │ │ │ ├─Achariaceae │ │ │ ├─Balanopaceae │ │ │ ├─Bonnetiaceae │ │ │ ├─Caryocaraceae │ │ │ ├─Chrysobalanaceae │ │ │ ├─Clusiaceae │ │ │ ├─Ctenolophonaceae │ │ │ ├─Dichapetalaceae │ │ │ ├─Elatinaceae │ │ │ ├─Erythroxylaceae │ │ │ ├─Euphorbiaceae │ │ │ ├─Euphroniaceae │ │ │ ├─Flacourtiaceae │ │ │ ├─Goupiaceae │ │ │ ├─Humiriaceae │ │ │ ├─Irvingiaceae │ │ │ ├─Ixonanthaceae │ │ │ ├─Lacistemataceae │ │ │ ├─Linaceae │ │ │ ├─Lophopyxidaceae │ │ │ ├─Malesherbiaceae │ │ │ ├─Malpighiaceae │ │ │ ├─Medusagynaceae │ │ │ ├─Ochnaceae │ │ │ ├─Pandaceae │ │ │ ├─Passifloraceae │ │ │ ├─Phyllanthaceae │ │ │ ├─Picrodendraceae │ │ │ ├─Podostemaceae │ │ │ ├─Putranjivaceae │ │ │ ├─Quiinaceae │ │ │ ├─Rafflesiaceae │ │ │ ├─Rhizophoraceae │ │ │ ├─Salicaceae │ │ │ ├─Trigoniaceae │ │ │ ├─Medusagynaceae │ │ │ └─Violaceae │ │ │ │ │ ├─Eurosids II │ │ │ │ │ │ │ ├─────Dipentodontaceae │ │ │ ├─────Tapisciaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Myrtales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Alzateaceae │ │ │ │ ├─Combretaceae │ │ │ │ ├─Crypteroniaceae │ │ │ │ ├─Heteropyxidaceae │ │ │ │ ├─Lythraceae │ │ │ │ ├─Melastomataceae │ │ │ │ ├─Memecylaceae │ │ │ │ ├─Myrtaceae │ │ │ │ ├─Oliniaceae │ │ │ │ ├─Onagraceae │ │ │ │ ├─Penaeaceae │ │ │ │ ├─Psiloxylaceae │ │ │ │ ├─Rhynchocalycaceae │ │ │ │ ├─Vochysiaceae │ │ │ │ └─Vochysiaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Brassicales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Akaniaceae │ │ │ │ ├─Bataceae │ │ │ │ ├─Brassicaceae │ │ │ │ ├─Caricaceae │ │ │ │ ├─Cleomaceae │ │ │ │ ├─Emblingiaceae │ │ │ │ ├─Gyrostemonaceae │ │ │ │ ├─Koeberliniaceae │ │ │ │ ├─Limnanthaceae │ │ │ │ ├─Moringaceae │ │ │ │ ├─Pentadiplandraceae │ │ │ │ ├─Resedaceae │ │ │ │ ├─Salvadoraceae │ │ │ │ ├─Setchellanthaceae │ │ │ │ ├─Tovariaceae │ │ │ │ └─Tropaeolaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Malvales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Bixaceae │ │ │ │ ├─Cistaceae │ │ │ │ ├─Cochlospermaceae │ │ │ │ ├─Dipterocarpaceae │ │ │ │ ├─Malvaceae │ │ │ │ ├─Muntingiaceae │ │ │ │ ├─Neuradaceae │ │ │ │ ├─Sarcolaenaceae │ │ │ │ ├─Sphaerosepalaceae │ │ │ │ └─Thymelaeaceae │ │ │ │ │ │ │ └─Sapindales │ │ │ │ │ │ │ ├─Anacardiaceae │ │ │ ├─Biebersteiniaceae │ │ │ ├─Burseraceae │ │ │ ├─Kirkiaceae │ │ │ ├─Meliaceae │ │ │ ├─Nitrariaceae │ │ │ ├─Rutaceae │ │ │ ├─Sapindaceae │ │ │ └─Simaroubaceae │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Asterids │ │ │ │ │ │ │ ├─Cornales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Cornaceae │ │ │ │ ├─Curtisiaceae │ │ │ │ ├─Grubbiaceae │ │ │ │ ├─Hydrangeaceae │ │ │ │ ├─Hydrostachyaceae │ │ │ │ ├─Loasaceae │ │ │ │ └─Nyssaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Ericales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Actinidiaceae │ │ │ │ ├─Balsaminaceae │ │ │ │ ├─Clethraceae │ │ │ │ ├─Cyrillaceae │ │ │ │ ├─Diapensiaceae │ │ │ │ ├─Ebenaceae │ │ │ │ ├─Ericaceae │ │ │ │ ├─Fouquieriaceae │ │ │ │ ├─Lecythidaceae │ │ │ │ ├─Lissocarpaceae │ │ │ │ ├─Maesaceae │ │ │ │ ├─Marcgraviaceae │ │ │ │ ├─Mitrastemonaceae │ │ │ │ ├─Myrsinaceae │ │ │ │ ├─Pellicieraceae │ │ │ │ ├─Pentaphylacaceae │ │ │ │ ├─Polemoniaceae │ │ │ │ ├─Primulaceae │ │ │ │ ├─Roridulaceae │ │ │ │ ├─Sapotaceae │ │ │ │ ├─Sarraceniaceae │ │ │ │ ├─Sladeniaceae │ │ │ │ ├─Styracaceae │ │ │ │ ├─Symplocaceae │ │ │ │ ├─Ternstroemiaceae │ │ │ │ ├─Tetrameristaceae │ │ │ │ ├─Theaceae │ │ │ │ └─Theophrastaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Euasterids I │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Boraginaceae │ │ │ │ ├─Icacinaceae │ │ │ │ ├─Oncothecaceae │ │ │ │ ├─Vahliaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Garryales │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Aucubaceae │ │ │ │ │ ├─Eucommiaceae │ │ │ │ │ └─Garryaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Garryales │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Apocynaceae │ │ │ │ │ ├─Gelsemiaceae │ │ │ │ │ ├─Gentianaceae │ │ │ │ │ ├─Loganiaceae │ │ │ │ │ └─Rubiaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Solanales │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Convolvulaceae │ │ │ │ │ ├─Hydroleaceae │ │ │ │ │ ├─Montiniaceae │ │ │ │ │ ├─Solanaceae │ │ │ │ │ └─Sphenocleaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ └─Lamiales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Acanthaceae │ │ │ │ ├─Avicenniaceae │ │ │ │ ├─Bignoniaceae │ │ │ │ ├─Buddlejaceae │ │ │ │ ├─Byblidaceae │ │ │ │ ├─Calceolariaceae │ │ │ │ ├─Carlemanniaceae │ │ │ │ ├─Gesneriaceae │ │ │ │ ├─Lamiaceae │ │ │ │ ├─Lentibulariaceae │ │ │ │ ├─Martyniaceae │ │ │ │ ├─Myoporaceae │ │ │ │ ├─Oleaceae │ │ │ │ ├─Orobanchaceae │ │ │ │ ├─Paulowniaceae │ │ │ │ ├─Pedaliaceae │ │ │ │ ├─Phrymaceae │ │ │ │ ├─Plantaginaceae │ │ │ │ ├─Plocospermataceae │ │ │ │ ├─Schlegeliaceae │ │ │ │ ├─Scrophulariaceae │ │ │ │ ├─Stilbaceae │ │ │ │ ├─Tetrachondraceae │ │ │ │ └─Verbenaceae │ │ │ │ │ │ │ └─Euasterids II │ │ │ │ │ │ │ ├─Adoxaceae │ │ │ ├─Bruniaceae │ │ │ ├─Columelliaceae │ │ │ ├─Eremosynaceae │ │ │ ├─Escalloniaceae │ │ │ ├─Polyosmaceae │ │ │ ├─Sphenostemonaceae │ │ │ ├─Eremosynaceae │ │ │ ├─Tribelaceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Aquifoliales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Aquifoliaceae │ │ │ │ ├─Cardiopteridaceae │ │ │ │ ├─Helwingiaceae │ │ │ │ ├─Phyllonomaceae │ │ │ │ └─Stemonuraceae │ │ │ │ │ │ │ ├─Apiales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Apiaceae │ │ │ │ ├─Araliaceae │ │ │ │ ├─Griseliniaceae │ │ │ │ ├─Melanophyllaceae │ │ │ │ ├─Griseliniaceae │ │ │ │ ├─Pennantiaceae │ │ │ │ ├─Pittosporaceae │ │ │ │ ├─Pennantiaceae │ │ │ │ └─Torricelliaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Dipsacales │ │ │ │ │ │ │ │ │ ├─Caprifoliaceae │ │ │ │ ├─Diervillaceae │ │ │ │ ├─Dipsacaceae │ │ │ │ ├─Linnaeaceae │ │ │ │ ├─Morinaceae │ │ │ │ └─Valerianaceae │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ └─Asterales │ │ │ │ │ │ │ ├─Alseuosmiaceae │ │ │ ├─Argophyllaceae │ │ │ ├─Asteraceae │ │ │ ├─Calyceraceae │ │ │ ├─Campanulaceae │ │ │ ├─Goodeniaceae │ │ │ ├─Menyanthaceae │ │ │ ├─Pentaphragmataceae │ │ │ ├─Phellinaceae │ │ │ ├─Rousseaceae │ │ │ └─Stylidiaceae │ │ (?) │ │ ├─Balanophoraceae │ │ ├─Cynomoriaceae │ │ ├─Cytinaceae │ │ ├─Haptanthaceae │ │ ├─Hoplestigmataceae │ │ ├─Medusandraceae │ │ ├─Metteniusaceae │ │ ├─Paracryphiaceae │ │ ├─Pottingeriaceae │ │ ├─Quintiniaceae │ │ └─Tepuianthaceae │ │ │ └─Ulvophytes ├─Lignée brune │ ├─Haptophytes │ └─Straménopiles ├─Euglénobiontes ├─Métamonadines ├─Mycétozoaires ├─Parabasiliens ├─Rhizopodes ├─Foraminifères ├─Actinopodes ├─Percolozoaires ├─Alvéolobiontes │ ├─Dinophytes │ ├─Apicomplexés │ └─Ciliés └─Opistochontes ├─Champignons │ ├─Eumycètes │ │ ├─Chytridiomycètes │ │ └─CNN │ │ ├─Zygomycètes │ │ └─CNN │ │ ├─Ascomycètes │ │ └─Basidiomycètes │ └─Microsporidies └─Choano-organismes ├─Choanoflagellés └─Métazoaires ├─Placozoaires ├─Éponges calcaires ou Calcarea ├─Éponges hexactinellides ├─Démosponges └─Eumétazoaires ├─Cnidaires │ ├─Medusozoa │ │ ├─hydrozoaires │ │ │ ├─Athecatae │ │ │ └─Syphonophores │ │ └─Scyphozoaires │ └─Anthozoaria │ └─Anthohozoaires │ ├─Octocoralliaires (ex : Cerianthus membranaceus et Actinia equina) │ └─Hexacoralliaires (ex : Pennatula phosphorea et Corallium rubrum et Alcyonium sp) │ ├─Actinaires │ └─Madreporaires ├─Cténophores ou Cténaires ├─Myxozoaires └─Bilatériens ├─Protostomiens │ ├─Lophotrochozoaires │ │ │─Eutrochozoaires │ │ │ ├─Syndermates │ │ │ │ ├─(?)Cicliophores │ │ │ │ ├─Rotifères │ │ │ │ └─Acanthocéphales │ │ │ ├─Spiraliens │ │ │ │ ├─Entoproctes │ │ │ │ ├─Parenchymiens │ │ │ │ │ ├─Plathelminthes │ │ │ │ │ └─Némertes │ │ │ │ └─Mollusques │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ ├─Solénogastres │ │ │ │ │ └─Caudofoveata ou Caudofovéates │ │ │ │ └─Eumollusques │ │ │ │ ├─Polyplacophores (ex : Chiton) │ │ │ │ └─Conchifères │ │ │ │ ├─Monoplacophores │ │ │ │ └─Ganglioneures │ │ │ │ ├─Viscéroconques │ │ │ │ │ ├─Céphalopodes (ex : Sepia officinalis) │ │ │ │ │ └─Gastéropodes (ex : Buccinum undatum et Aplysia punctata) │ │ │ │ └─Diasomes │ │ │ │ ├─Scaphopodes │ │ │ │ └─Bivalves (ex : Pecten maximus et Cerastoderma edule) │ │ │ ├─Siponcles │ │ │ └─Annélides │ │ │ ├─Polychètes (ex : Nereis diversicolor et Lanice conchilega) │ │ │ ├─Oligochètes (ex : Lumbricus terrestris) │ │ │ ├─Achètes ou Hirudinées (ex: Pontobdella sp et Hirudo medicinalis) │ │ │ ├─Echiuriens (ex: Bonellia viridis) │ │ │ ├─Pogonophores (ex: Lamellisabella denticulata) │ │ │ ├─Vestimentifères (ex: Riftia pachyptila) │ │ │ └─Gnathostomulidess (ex: Gnathostomula armata) │ │ │ │ │ └─Lophophorates │ │ ├─Ectoproctes │ │ └─Phoronozoaires │ │ ├─Phoronidiens │ │ └─Brachiopodes │ ├─(?)Chaetognathes │ └─Cuticulates │ ├─Gastrotriches │ └─Ecdysozoaires │ ├─Panarthropodes │ │ ├─Euarthropodes │ │ │ ├─Chélicériformes │ │ │ │ ├─Pycnogonides │ │ │ │ └─Chélicérates │ │ │ │ ├─Mérostomes │ │ │ │ └─Arachnides │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Scorpionides │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ │ ├─Uropyges │ │ │ │ │ │ └─Schizomides │ │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ │ ├─Amblypyges │ │ │ │ │ └─Arénéides ou araignées │ │ │ │ ├─Palpigrades │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ ├─Solpugides │ │ │ │ │ └─Pseudoscorpionides │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Opilionides │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Ricinulides │ │ │ │ └─Acariens │ │ │ └─Mandibulates ou Antennates │ │ │ ├─Myriapodes │ │ │ └─Pancrustacés │ │ │ ├─Rémipèdes │ │ │ ├─Céphalocarides │ │ │ ├─Maxillopodes │ │ │ ├─Branchiopodes │ │ │ ├─Malacostracés (ex: Porcellio scaber) │ │ │ └─Hexapodes │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ ├─Protoures │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ ├─Diploures │ │ │ │ │ └─Collemboles │ │ │ │ ├─Campodeoïdes │ │ │ │ └─Japygoïdes │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─Archéognathes │ │ │ └─Insectes │ │ │ ├─Thysanoures │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─Odonates │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─Éphéméroptères │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ │ ├─Blattoptères │ │ │ │ │ │ ├─Mantoptères (ex: Mantis religiosa) │ │ │ │ │ │ └─Isoptères │ │ │ │ │ ├─Plécoptèroïdes │ │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ │ ├─Orthoptères │ │ │ │ │ ├─Dermaptères │ │ │ │ │ ├─Grylloblattoptères │ │ │ │ │ ├─Embioptères │ │ │ │ │ └─Phasmides │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Zoraptères │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ ├─Psocoptères │ │ │ │ │ └─Phtiraptères │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Hémiptères │ │ │ │ └─Thysanoptères │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ │ ├─Strepsiptères │ │ │ │ │ └─Coléoptères │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Névroptères │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Rhaphidioptères │ │ │ │ └─Mégaloptères │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─Hyménoptères │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─CNN │ │ │ │ ├─Mécoptères │ │ │ │ └─CNN │ │ │ │ ├─Siphonaptères │ │ │ │ └─Diptères │ │ │ └─CNN │ │ │ ├─Trichoptères │ │ │ └─Lépidoptères │ │ │ │ │ ├─Onychophores │ │ └─Tardigrades │ └─Introvertés │ ├─Nématozoaires │ │ ├─Nématodes │ │ └─Nématomorphes │ └─Céphalorhynches │ ├─Kinorhynches │ ├─Loricifères │ └─Priapuliens ├─(?)Mésozoaires └─Deutérostomiens ├─Échinodermes └─Pharyngotrèmes ├─Hémichordés └─Chordés ├─Urochordés └─Myomérozoaires ├─Céphalochordés └─Craniates ├─Myxinoïdes └─Vertébrés ├─Pétromyzontides (ex: Lampetra fluviatis) └─Gnathostomes ├─Chondrichthyens (ex: Scyliorhinus canicula et Chimaera monstrosa) └─Ostéichthyens ├─Actinoptérygiens │ ├─Cladistiens (ex: Polypterus bichir) │ └─Actinoptères │ ├─Chondrostéens (ex: Acipenser surio) │ └─Néoptérygiens │ ├─Ginglymodes │ └─Halécostomes │ ├─Halécomorphes │ └─Téléostéens (ex: Anguilla anguilla et Solea solea) └─Sarcoptérygiens ├─Actinistiens └─Rhipidistiens ├─Dipneustes (ex: Protopterus sp) └─Tétrapodes ├─Lissamphibiens │ ├─Gymnophiones │ └─Batraciens │ ├─Anoures (ex: Alytes obstetricans et Pipa pipa) │ └─Urodèles (ex: Salamandra salamandra et Ambystoma mexicanum │ et Proteus anguinus) └─Amniotes ├─Sauropsides │ ├─(?) Chéloniens (ex: Dermochelys coriacea et Emys orbicularis et Testudo hermanni) │ │ │ └─Diapsides │ ├─Lépidosauriens │ │ ├─Squamates │ │ └─Sphénodontiens │ │ │ └─Archosauriens │ ├─Crocodiliens (ex: Crocodylus niloticus) │ └─Oiseaux │ ├─Ardeiformes (ex: Ardea cinerea) │ ├─Charadriiformess (ex: Recurvirostra avocetta) │ ├─Ciconiiformes (ex: Phoenicopterus ruber) │ ├─Columbiformes (ex: Streptopelia decaocto) │ ├─Falconiformes (ex: Gyps fulvus) │ ├─Paléognathes (ex: Apterix australis │ │ et Struthio camelus) │ └─Passeriformes (ex: Sturnus vulgaris) └─Mammifères ├─Monotrèmes (ex: Ornithorhynchus anatinus) └─Thériens ├─Marsupiaux (ex: Macropus rufus) └─Euthériens ├─Xénarthres └─Épithériens ├─Pholidotes └─Preptothériens ├─Insectivores (ex: Erinaceus europaeus) ├─Carnivores ├─Archontes │ ├─Volitantiens │ │ ├─Chiroptères (ex: Pipistrellus pipistrellus) │ │ └─Dermoptères │ │ │ └─Primates │ ├─Strepsirrhiniens │ │ ├─Lorisiformes │ │ └─Lémuriformes │ │ │ └─Haplorrhiniens │ ├─Platyrrhiniens │ └─Simiiformes │ └─Catarrhiniens │ ├─Cercopithécoïdes │ │ └─Cercopithécidés │ └─Hominoïdes │ ├─Hylobatoïdés │ └─Hominoïdés │ ├─Pongidés (ex: Pongo pygmaeus) │ └─Hominidés │ ├─Gorillinés │ └─Homininés │ ├─Panines (ex: Pan troglodytes) │ └─Hominines │ ├─Australopithèques (éteints) │ └─Homo │ └┬Homo rudolfensis (éteint) │ └┬Homo habilis (éteint) │ └┬Homo ergaster (éteint) │ └┬Homo antecessor (éteint) │ └┬┬Homo erectus (éteint) │ │└Homo floresiensis (éteint) │ ├─Homo neanderthalensis (éteint) │ └──Homo sapiens ├─Anagalides │ └─Glires │ ├─Lagomorphes │ └─Rongeurs (ex: Marmota marmota) └─Ongulés ├─Tubulidentés └─Cétongulés ├─Cétartiodactyles │ ├─Tylopodes │ └─CNN │ ├─Suines (ex: Sus scrofa) │ └─CNN │ ├─Ruminants │ └─CNN │ └─CNN │ ├─Hippopotamidés │ └─Cétacés (ex: Orcinus orca et Physeter macrocephalus) │ └─Altongulés ├─Périssodactyles │ ├─Mésaxoniens │ └─Hyracoïdes └─Téthythériens ├─Siréniens └─Proboscidiens
Remarque
- (?) signifie une incertitude sur le taxon, incertitude des contributeurs ou des systématiciens eux même.
- CNN signifie clade non nommé
Voir aussi
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Liens internes
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